All modules for which code is available

• sctoolbox.plotting.clustering
• sctoolbox.plotting.embedding
• sctoolbox.plotting.general
• sctoolbox.plotting.genometracks
• sctoolbox.plotting.highly_variable
• sctoolbox.plotting.marker_genes
• sctoolbox.plotting.qc_filter
• sctoolbox.plotting.velocity
• sctoolbox.tools.bam
• sctoolbox.tools.calc_overlap_fc
• sctoolbox.tools.celltype_annotation
• sctoolbox.tools.clustering
• sctoolbox.tools.dim_reduction
• sctoolbox.tools.embedding
• sctoolbox.tools.frip
• sctoolbox.tools.gene_correlation
• sctoolbox.tools.highly_variable
• sctoolbox.tools.insertsize
• sctoolbox.tools.marker_genes
• sctoolbox.tools.multiomics
• sctoolbox.tools.norm_correct
• sctoolbox.tools.peak_annotation
• sctoolbox.tools.qc_filter
• sctoolbox.tools.receptor_ligand
• sctoolbox.tools.tobias
• sctoolbox.tools.tsse
• sctoolbox.utils.adata
• sctoolbox.utils.assemblers
• sctoolbox.utils.bioutils
• sctoolbox.utils.checker
• sctoolbox.utils.creators
• sctoolbox.utils.decorator
• sctoolbox.utils.general
• sctoolbox.utils.io
• sctoolbox.utils.jupyter
• sctoolbox.utils.multiprocessing
• sctoolbox.utils.tables